Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS1P17812 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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