Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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