Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RARBP10826 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RARBP10826 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RARBP10826 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms