Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CSN3P07498 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms