Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F9P00740 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F9P00740 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F9P00740 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms