Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms