Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V9GYV3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V9GYV3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V9GYV3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V9GYV3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V9GYV3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V9GYV3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V9GYV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V9GYV3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V9GYV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V9GYV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V9GYV3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GYV3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GYV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GYV3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V9GYV3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V9GYV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V9GYV3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V9GYV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms