Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT3AQ9Y6K1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3AQ9Y6K1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3AQ9Y6K1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms