Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPG1Q9Y678 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPG1Q9Y678 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms