Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAI2Q9Y5P3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAI2Q9Y5P3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAI2Q9Y5P3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms