Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC44.58■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
DCAF1Q9Y4B6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
DCAF1Q9Y4B6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
DCAF1Q9Y4B6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
DCAF1Q9Y4B6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms