Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2L3Q9Y4A8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFE2L3Q9Y4A8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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