Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KIF3AQ9Y496 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF3AQ9Y496 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF3AQ9Y496 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms