Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms