Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
R3HCC1Q9Y3T6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HCC1Q9Y3T6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms