Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIGD1AQ9Y241 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIGD1AQ9Y241 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms