Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNND2Q9UQB3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNND2Q9UQB3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNND2Q9UQB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms