Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
L1RE1Q9UN81 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
L1RE1Q9UN81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms