Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSEQ9UL01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DSEQ9UL01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSEQ9UL01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms