Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJD2Q9UKL4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJD2Q9UKL4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms