Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CROTQ9UKG9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms