Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRTO4Q9UKD2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRTO4Q9UKD2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms