Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCAN3Q9UKA8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCAN3Q9UKA8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.4 ms