Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBE1Q9UJT0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBE1Q9UJT0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms