Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMPXQ9UHP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMPXQ9UHP9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms