Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms