Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNAL1Q9UBT7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNAL1Q9UBT7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms