Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCDNQ9UBB6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCDNQ9UBB6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms