Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4Q9P0V3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4Q9P0V3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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