Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L1Q9P0L9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L1Q9P0L9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms