Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW6

NMRK1, Nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1Q9NWW6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMRK1Q9NWW6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NMRK1Q9NWW6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMRK1Q9NWW6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms