Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OXSMQ9NWU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXSMQ9NWU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms