Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLE1Q9NVX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLE1Q9NVX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms