Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL11Q9NVR0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL11Q9NVR0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms