Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3GQ9NS98 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3GQ9NS98 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms