Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ARHGAP35Q9NRY4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ARHGAP35Q9NRY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ARHGAP35Q9NRY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms