Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLE3Q9NRF9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLE3Q9NRF9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms