Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf4Q9NR00 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf4Q9NR00 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms