Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCUBE2Q9NQ36 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCUBE2Q9NQ36 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCUBE2Q9NQ36 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms