Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4CQ9HCJ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4CQ9HCJ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4CQ9HCJ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms