Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPCSQ9HAB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPCSQ9HAB8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPCSQ9HAB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms