Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC68Q9H2F9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC68Q9H2F9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms