Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS16Q9H269 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS16Q9H269 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS16Q9H269 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS16Q9H269 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS16Q9H269 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS16Q9H269 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS16Q9H269 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS16Q9H269 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms