Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3FQ9H1D9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3FQ9H1D9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3FQ9H1D9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms