Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGIF2Q9GZN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms