Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC27Q9C0I9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC27Q9C0I9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC27Q9C0I9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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