Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM6SF2Q9BZW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms