Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
YTHDF1Q9BYJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
YTHDF1Q9BYJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
YTHDF1Q9BYJ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms