Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTRT3Q9BYD9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTRT3Q9BYD9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTRT3Q9BYD9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms