Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL1Q9BYD6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL1Q9BYD6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms